اعتمدت سلطة المياه الفلسطينية مبدأ التخطيط الإستراتيجي المتوسط والبعيد المدى كأساس لمتابعة وتنفيذ أعمالها ومهامها كما حددها القانون، من أجل تحقيق الهدف العام المنوط بسلطة المياه والذي يهدف الى تحقيق الإدارة المتكاملة والمستدامة لمصادر المياه ويعمل على الحفاظ عليها وحمايتها . وذلك إنطلاقا لادراك السلطة الكبير لأهمية التخطيط الإستراتيجي لقطاع المياه والصرف الصحي للوصول الى تطبيق فعلي ودقيق لمفاهيم الإدارة المتكاملة لمصادر المياه المستدامة في فلسطين .حيث يتم إعداد الإستراتيجيات بالإعتماد على معطيات وتحليلات وباستخدام منهجية تشاركية لكافة الوحدات التنظيمية والعاملين في سلطة المياه الفلسطينية والمؤسسات ذات العلاقة ، حيث قامت سلطة المياه بتطوير الإطار الاستراتيجي المؤسسي بشكل يساعدها على تفعيل دورها القيادي في تطوير قطاع المياه الفلسطيني وتحقيق الأهداف القطاعية لهذا القطاع التنموي والحيوي والذي يعتبر ً رافعة حقيقية للتنمية الوطنية من أجل تحقيق التوجه الإستراتيجي العام لسلطة المياه .